Kekkei Genkai, inaczej zwane również ograniczeniem więzów krwi, to specjalne umiejętności dziedziczone genetycznie z rodzica na dziecko. Zdolności te są niepowtarzalne. Każdy klan posiada własne, nigdzie indziej nie spotykane bloodline. Bardzo często umiejętności te są przydatne w walce. Dają one niewyobrażalną przewagę nad wrogiem, dają więcej możliwości wykonania ataku lub obrony.